Fakultas Pertanian Universitas Islam Riau (UIR) didirikan pada tahun 1977, dengan mengembangkan tiga jurusan/program studi yaitu Jurusan Budidaya Pertanian/Program Studi Agronomi, Jurusan Sosial Ekonomi Pertanian/Program Studi Sosial Ekonomi Pertanian dan Jurusan Perikanan/Program Studi Budidaya Perairan. Seluruh Program Studi yang dimiliki Fakultas Pertanian sudah diakreditasi oleh Badan Akreditasi Nasional (BAN). Program Studi Agroteknologi diakreditasi dengan Surat Keputusan Badan Akreditasi Nasional Perguruan Tinggi No. 013/BAN-PT/AK-SUV-i/SI/IX2009 tanggal 11 September 2009. Program Studi Agribisnis diakreditasi, dengan Surat Keputusan Badan Akreditasi Nasional No. 008/BAN-PT/AK-IX/S1/VI/2005 tanggal 23 Juni 2005, serta Program Studi Budidaya Perairan, dengan Surat Keputusan Badan Akreditasi Nasional No.009/BAN-PT/AK-IX/2006. Namun dengan keluarnya SK tahun 2008, tentang pergantian nama, untuk jurusan Budidaya Pertanian Program Studi Agronomi menjadi Program Studi Agroteknologi dan Jurusan Sosial Ekonomi Pertanian menjadi Program Studi Agribisnis.

Berdasarkan Surat Keputusan BAN-PT No. 3391/SK/BAN-PT/Akred/S.1/X/2017, menyatakan bahwa Program Study Sarjana Agribisnis, Universitas Islam Riau, Pekanbaru terakreditasi dengan peringkat A, yang berlaku sampai tanggal 12 September 2022. Prodi Budidaya Perairan juga memperoleh nilai Akreditasi yang sama yaitu A dengan Surat Keputusan BA-PT No. 2994/SK/BAN-PT/Akred/ S/VIII/2017 dengan masa berlaku sampai tahun 22 Agustus 2022 mendatang.

Berkat kerja keras sivitas akademika Fakultas Pertanian UIR, pada tanggal 28 Mei 2014, Program Study Sarjana Agroteknologi Universitas Islam Riau, Pekanbaru terakreditasi dengan peringkat Akreditasi A. Hal ini sesuai dengan sertifikat akreditasi BAN-PT No. 2035/SK/BAN-PT/Akred/S/VI/2019 dan berlaku sampai dengan 25 Juni 2024. Kehadiran Fakultas Pertanian di tengah-tengah masyarakat, khususnya di Provinsi Riau pada umumnya bertujuan untuk membantu meningkatkan sumberdaya manusia dalam bidang pertanian dalam arti luas dan untuk menjawab tantangan dan peluang pengembangan sektor pertanian yang berorientasi agribisnis dan aquabisnis.